정보

    • 업무명     : 기초통계 : Benjamini-Hochberg 보정

    • 작성자     : 박진만

    • 작성일     : 2020-04-16

    • 설   명      :

    • 수정이력 :

     

     내용

    [개요]

     

    [특징]

    • 통계이론 설명

     

    [활용 자료]

    • 없음

     

    [자료 처리 방안 및 활용 분석 기법]

    • 없음

     

    [사용법]

    • 내용 참조

     

     

     상세 내용

    [Benjamini-Hochberg 보정]

    • FDR (False Discovery Rate)은 실제 귀무 가설의 오탐율을 나타낸다.

    • 예를 들어 FDR = 0.1에서 100 개의 귀무 가설을 검정하고 20 개의 가설을 기각했다고 가정하자.

    • 현재 20 개의 기각 된 가설 중 20 x 0.1 = 2 미만의 가설은 실수로 기각 된 것으로 생각된다.

    • 이 경우 전술 한 바와 같이, FDR을 제어함으로써 보정을위한 다양한 방법이 제안되어 왔다.

    • 제안 된 첫 번째 방법은 Benjamini와 Hochberg의 수정 방법이다. 이 방법에서, 보정은 아래의 절차에 의해 수행된다.

      1.  FDR을 결정한다. 여기서 α로한다.

      2. m 개의 귀무 가설 각각에 대해 검정을 실시하여 p 값을 계산한다.

      3. m 개의 p 값을 오름차순으로 정렬하고, p 1 ≤ p 2 ≤ ... ≤ p m 으로 정한다. 여기에서 귀무 가설 i에 대응하는 p 값을 p i 로한다.

      4. j = m로 둔다.

      5. \(p_{j} \leq \frac{\alpha j}{m}\)

      6. 귀무 가설 1 귀무 가설 2, ..., 귀무 가설 j를 기각하고 종료한다.

     

    [R을 이용한 q-value의 계산]

    • R의 p.adjust함수를 사용하여 Benjamini-Hochberg 법에 의한 보정을 할 수 있다. 

    • 위 함수를 사용하면 p 값에서 q 값이 계산된다. 가설의 기각은 q <α를 충족 가설을 기각한다.

    p.values <- runif(100)
    q.values <- p.adjust(p.values, method = "BH")
    
    is.significant <- (q.values < 0.1)

     

     

     

     참고 문헌

    [논문]

    • 없음

    [보고서]

    • 없음

    [URL]

    • 없음

     

     문의사항

    [기상학/프로그래밍 언어]

    • sangho.lee.1990@gmail.com

    [해양학/천문학/빅데이터]

    • saimang0804@gmail.com

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

     

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